Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRAMEF22A3QJZ6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms