Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
USP15Q9Y4E8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms