Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KNSTRNQ9Y448 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms