Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP20Q9Y2K6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
USP20Q9Y2K6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms