Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TTF2Q9UNY4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms