Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGA11Q9UKX5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ITGA11Q9UKX5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms