Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms