Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHPF2Q9P2E5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms