Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HCN3Q9P1Z3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms