Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PFDN4Q9NQP4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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