Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
APOBEC3GQ9HC16 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
APOBEC3GQ9HC16 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms