Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM8Q9BZR9 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms