Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KDM5DQ9BY66 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KDM5DQ9BY66 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms