Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CACNG6Q9BXT2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CACNG6Q9BXT2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms