Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HIRIP3Q9BW71 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HIRIP3Q9BW71 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms