Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
KCNS3Q9BQ31 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms