Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMAD5Q99717 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms