Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNX1Q96RV3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNX1Q96RV3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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