Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGCZQ96LD1 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGCZQ96LD1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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