Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SIRT1Q96EB6 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms