Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NKD1Q969G9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms