Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBXN4Q92575 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBXN4Q92575 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms