Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C9orf43Q8TAL5 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms