Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RPAP2Q8IXW5 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms