Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
APTXQ7Z2E3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APTXQ7Z2E3 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms