Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BHLHA9Q7RTU4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms