Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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LINC00299Q6ZSB3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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LINC00299Q6ZSB3 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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LINC00299Q6ZSB3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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LINC00299Q6ZSB3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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LINC00299Q6ZSB3 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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LINC00299Q6ZSB3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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LINC00299Q6ZSB3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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LINC00299Q6ZSB3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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LINC00299Q6ZSB3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
LINC00299Q6ZSB3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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