Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TPTE2Q6XPS3 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms