Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LINGO4Q6UY18 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms