Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TSSK4Q6SA08 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms