Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL35Q6PF15 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL35Q6PF15 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms