Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
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C9orf135Q5VTT2 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.02■□□□□ -0
C9orf135Q5VTT2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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C9orf135Q5VTT2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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C9orf135Q5VTT2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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C9orf135Q5VTT2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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C9orf135Q5VTT2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
C9orf135Q5VTT2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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