Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBAP2Q5T6F2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms