Protein–RNA interactions for Protein: Q53H64

LINC00483, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00483, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00483Q53H64 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
LINC00483Q53H64 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms