Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC39A12Q504Y0 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms