Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HIF1AQ16665 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HIF1AQ16665 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
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