Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SGCAQ16586 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SGCAQ16586 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SGCAQ16586 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SGCAQ16586 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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SGCAQ16586 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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SGCAQ16586 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCAQ16586 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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