Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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E2F4Q16254 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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E2F4Q16254 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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E2F4Q16254 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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E2F4Q16254 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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E2F4Q16254 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F4Q16254 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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E2F4Q16254 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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E2F4Q16254 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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E2F4Q16254 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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E2F4Q16254 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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E2F4Q16254 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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E2F4Q16254 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
E2F4Q16254 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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