Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SKIV2LQ15477 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SKIV2LQ15477 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms