Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SHPRHQ149N8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
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