Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NFIXQ14938 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms