Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPIDRQ14159 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms