Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM53BQ14153 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms