Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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COL4A6Q14031 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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COL4A6Q14031 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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COL4A6Q14031 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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COL4A6Q14031 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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COL4A6Q14031 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
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COL4A6Q14031 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
COL4A6Q14031 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
COL4A6Q14031 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
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