Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAPSNQ13702 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms