Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEUROD1Q13562 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEUROD1Q13562 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
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