Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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ITGB3BPQ13352 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
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ITGB3BPQ13352 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ITGB3BPQ13352 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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