Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CALCOCO2Q13137 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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