Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PTPN13Q12923 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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PTPN13Q12923 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PTPN13Q12923 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PTPN13Q12923 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PTPN13Q12923 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PTPN13Q12923 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PTPN13Q12923 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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