Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CNTN1Q12860 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CNTN1Q12860 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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CNTN1Q12860 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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CNTN1Q12860 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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CNTN1Q12860 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CNTN1Q12860 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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